Jeune institution dynamique, la HEP-BEJUNE a été la première en Suisse à obtenir une reconnaissance de ses programmes par la Conférence suisse des directeurs cantonaux de l'instruction publique (CDIP). La HEP-BEJUNE est reconnue pour la qualité de ses formations, tant initiales que continues, mais aussi pour son rayonnement national et international: les étudiants ont la possibilité de participer à différents échanges avec d'autres institutions suisses, européennes et internationales, notamment au Canada ou au Brésil.

La HEP-BEJUNE défend une vision professionnelle de la formation des enseignants, reposant sur une articulation forte entre la théorie et la pratique, entre les cours et les stages. Institution tricantonale, la HEP-BEJUNE offre à ses étudiants plusieurs types de services (médiathèques, informatiques, etc.) dans l'ensemble de ses quatre sites. Elle collabore étroitement avec l'Université de Neuchâtel pour les formations au secondaire 1 et 2. Depuis la création de l'institution en 2001, ses étudiants ont réussi chaque année une très bonne insertion sur le marché de l'emploi.